Alicja Molitorys ukończyła z wyróżnieniem Akademię Muzyczną im. Karola Szymanowskiego w Katowicach. Studia uzupełniała w Musikhögskolan w Malmö w klasie Andersa Ljungar-Chapelon, podczas rocznego stypendium Svenska Institutet. W roku 2022 uzyskała stopień naukowy doktora sztuki w Uniwersytecie Muzycznym Fryderyka Chopina w Warszawie. Swoje umiejętności doskonaliła na kursach mistrzowskich w Wielkiej Brytanii. W latach 1998 i 1999 była finalistką konkursu fletowego im. Alberta Coopera w Stratford-upon-Avon (Wielka Brytania), a w roku 1998 otrzymała nagrodę specjalną Meg River Prize na tymże konkursie. Jest stypendystką Oxford Flute Summer School. Jako solistka i kameralistka brała udział w ogólnopolskich oraz międzynarodowych festiwalach muzycznych, m.in. International Flute Festival w Stratford-upon-Avon (Wielka Brytania), I Djur & Mols w Danii, La Côte Flûte Festival w Szwajcarii. W 2019 została zaproszona jako artystka rezydentka na Journées Art & Science w Saint-Etienne (Francja). W roku 2022 wygrała Call for performers, co skutkowało zaproszeniem do występów podczas Festiwalu CAMPGround w USA. Jako solistka występowała z orkiestrą Filharmonii Śląskiej, Orkiestrą Muzyki Nowej oraz Orkiestrą Kameralną Archetti. W 2021 roku dokonała prawykonania koncertu fletowego Ryszarda Osady w sali kameralnej NOSPR w Katowicach, a powtórzonego podczas koncertu otwarcia 33. Międzynarodowego Festiwalu Kompozytorów Krakowskich. Te wykonania zostały uhonorowane statuetką Muzyczny Orzeł na II Międzynarodowym Konkursie organizowanym przez Fundację Muzyka do Potęgi w kategorii Prawykonanie.
Specjalizuje się w muzyce współczesnej, dokonała około stu prawykonań, a także licznych nagrań dzieł kompozytorów polskich i zagranicznych. Jeszcze podczas studiów rozpoczęła współpracę z tworzącą się wtedy na Akademii Muzycznej w Katowicach Orkiestrą Muzyki Nowej. Jest pierwszą flecistką orkiestry, z którą debiutowała na Międzynarodowym Festiwalu Muzyki Współczesnej „Warszawska Jesień” w roku 2000. Wraz OMN występuje regularnie na polskich festiwalach muzyki współczesnej oraz na koncertach za granicą (Chiny, Dania, Niemcy, Norwegia, Belgia, Słowacja, Austria). Wraz z Aleksandrą Batog (altówka) oraz Agnieszką Kaczmarek-Bialic (harfa) założyła Lorien Trio, które od 2004 roku koncertowało na Litwie, w Turcji i Chinach oraz w wielu miastach Polski. Trio zamówiło i prawykonało ponad 20 utworów polskich i zagranicznych twórców. W 2012 roku flecistka nawiązała współpracę artystyczną z japońską pianistką Rinko Yoshino. Artystki występują regularnie na zmianę w Polsce i w Japonii, promując przede wszystkim muzykę swoich krajów.